Noel Kempff Mercado, quien a principios de la década de 1960, tenía ya una carrera hecha como naturalista y creador del Jardín Botánico, situado a orillas del río Piraí.

Como resultado concibió la idea de construir un zoológico dedicado exclusivamente a la fauna Sudamericana.

También debe recordarse que, simultáneamente y como Director Municipal de Parques y Jardines, fue él quien inició el proceso de arborización urbana que ha dado a la ciudad un aspecto inconfundible.

Noel Kempff Mercado hizo un viaje a Europa durante el cual tuvo oportunidad de observar viejos y nuevos zoológicos.

Dando parte correspondiente a los resultados del diagnóstico, el equipo técnico del Zoológico, tomo acciones para la realización del Plan Estratégico Funcional, detallando en el mismo todos los planes de acuerdo a las áreas de acción, que forma parte nuestra institución, pero, debido a constantes cambios de carácter político en el personal técnico-administrativo, se obstaculiza la coordinación y concretización del Plan Estratégico Funcional Quinquenal para el Zoológico Fauna Sudamericana.