De joven fue enviado a aprender la santa Torá con el rabino Tzvi Hirsch Broide, con quien inició sus estudios religiosos.
Fue en Salantai donde Salanter conoció a Yosef Zundel, un discípulo cercano del Rabino Jaim de Volozhin, y a través de su influencia, se interesó en la cuestión del mejoramiento moral.
Alrededor del año 1833, conoció al joven Rabino Alexander Moshé Lapidos, el cual se convirtió en su alumno y compañero.
Poco después, se trasladó a Zaretcha, un suburbio de Vilna, donde enseñó la Torá en la yeshivá local.
El Rabino Yisroel promovía el movimiento del Musar para hacer volver a las personas al buen camino.