Participó en los campeonatos regionales hasta que en la temporada 1965/66 consiguió el ascenso a Tercera División, pero solo se mantuvo dos años en la categoría.

En esta etapa encadena 10 años seguidos en Tercera, hasta que en la temporada 1989/90 se proclama campeón y asciende por primera vez a Segunda División B.

En la última jornada del grupo el Yeclano se enfrenta al Atlético Marbella en Yecla, los marbellíes son líderes del grupo con 8 puntos y los yeclanos segundos con 6.

El Yeclano necesita ganar por dos goles de diferencia para lograr el ascenso, sin embargo no pudo pasar del empate a 0.

[2]​ Tras el descenso el equipo desaparece y se funda un nuevo club en la ciudad, el Yeclano Deportivo, en la categoría más baja del fútbol regional.