La relación entre la humanidad y las máquinas es fundamental para la trama del juego, como lo indica la presencia de robots gigantes llamados "Gears", que casi cada personaje jugable puede controlar.
Gracias a diferentes equipos de fanes Xenogears se vio traducido al español después de varios años con más fidelidad a la versión japonesa, por supuesto, al ser solo por y para fanes, este no vio su salida en las tiendas.
Los gears, en cambio, no pueden ser curados en combates por lo que se deben llevar a mecánicos para restaurarle la vida y combustible.
El jugador se desplaza a través de escenarios completamente tridimensionales permitiendo rotar la cámara 45° por otro lado el personaje se encuentra representado en dos dimensiones, estos podrán agruparse en tríos del cual en algunas ocasiones decidiremos que personaje podrá formar parte.
Como es habitual en cualquier RPG, los personajes podrán ser equipados a gusto del jugador con el objetivo de mejorar sus estadísticas.
A pesar de que Kislev originalmente era el reino dominante en la guerra, un misterioso ejército conocido como Gebler aparece en la historia y empieza a ayudar al reino de Aveh.
A medida que la historia se va desenvolviendo, el entorno de la guerra se amplia a todo el mundo y los dos países flotantes de Shevat y Solaris.
Xenogears cuenta con un total de nueve personajes jugables abarcando diferentes áreas del mundo, El juego tiene comienzo con Ignas, un continente con dos nacioness, Aveh y Kislev.
Citan es un hombre quien lleva consigo un vasto conocimiento del mundo y su tecnología, el cual a menudo ayuda en las misiones.
Xenogears posee unos de los argumentos más cuidados, maduros y complejos jamás escritos para un videojuego.