Krätschmer estudió física en Berlín.

Después de su diploma, fue al Instituto Max Planck de Física Nuclear en Heidelberg y obtuvo su doctorado allí en 1971 con una tesis sobre huellas grabadas artificialmente de iones pesados acelerados en cuarzo.

En su carrera, ha trabajado en pistas de iones pesados de rayos cósmicos en muestras lunares, así como en espectros infrarrojos y UV de polvo interestelar.

Este procedimiento fue el primero en producir fullerenos en grandes cantidades para experimentos químicos.

Desde 1993 es profesor honorario en la Universidad de Heidelberg.