Además de luchar contra el ejército de la Alemania nazi, con frecuencia debe luchar contra experimentos nazis que incluyen tecnología biomecánica y ocultismo.
El argumento de varios juegos de ID Software contiene pistas que relacionan a sus personajes con William Blazkowicz.
Así, en Wolfenstein: The New Order, se narra la relación de William con Anya Oliwa, con la que mantiene relaciones sexuales.
[1] Por otra parte, en Wolfenstein RPG se narra la lucha de William contra un demonio que, al ser vencido, promete que volverá en el futuro para luchar contra uno de sus descendientes.
Según los creadores originales de DOOM, Tom Hall y John Romero, vía Twitter mencionaron que el protagonista de Doom si era descendiente directo de William, es el hijo de Arthur (Commander Keen), lo que especularon a decir que su nombre incluso podría ser también William Blazkowicz III.