Tuvo también un papel importante en el mantenimiento del Jardín botánico de su padre, añadiéndole varias especies raras.[1] En 1773 se fue solo en un viaje que duró 4 años a través de 8 colonias sureñas.En 1774, celebraron la visita de William Bartram a su asentamiento principal en Cuskowilla con una gran fiesta.Cuando William Bartram le explicó a Cowkeeper que estaba interesado en estudiar los animales y plantas locales, al jefe le hizo gracia y empezó a llamarlo "Puc-puggee," o "el cazador de flores."Durante este tiempo recopiló la más completa lista de pájaros americanos hasta entonces existente.