Su principal interés en esta etapa fue la poesía y sus poemas sobre el maltrato que recibían los tejedores de sus patrones le ocasionaron algunos problemas con las autoridades.
En mayo de 1794, Wilson dejó Escocia con su sobrino buscando una vida mejor en América.
Fue allí donde conoció al famoso naturalista William Bartram quien le despertó el interés por la ornitología.
Wilson murió durante la redacción del noveno volumen, que fue completado por un amigo, George Ord, después de su muerte.
Un género zoólogico del orden de los passeriformes, Wilsonia, fue nombrado en su honor por Charles Lucien Bonaparte.