Después de crearse las Fuerzas Espaciales de Rusia en 2001, el entonces Mayor General Popovkin fue nombrado primer Jefe Mayor por el presidente Vladímir Putin.

[9]​[10]​ Kommersant dijo que se desmayó en las escaleras fuera de la agencia y el tabloide ruso Life News afirmó que había sido hospitalizado por lesiones en la cabeza.

Otros medios de comunicación afirmaron que fue hospitalizado después de ser golpeado en la cabeza con una botella durante una pelea, y que la lucha había terminado gracias a su secretario de prensa y a la exmodelo Anna Vedicheva.

[13]​ En respuesta, el desarrollador de Sistemas Espaciales de Rusia GLONASS (Российские космические системы) publicó una carta abierta del director Iván Golub pidiendo a Popovkin renunciar, en parte debido a la pelea, aunque principalmente debido a la demanda hecha por Popovkin de malversación de fondos en GLONASS.

Roscosmos respondió negando que Popovkin resultó herido después de una pelea.

Yo firmo una carta de renuncia al día siguiente ... Me respeto mucho, y francamente, todavía no puedo manejar toda esa basura que se dijo inmerecidamente de mí".

[17]​ Popovkin tenía un hermano, Vasily, tres años menor que él.