Inició sus estudios en el Seminario de Santo Domingo (Oviedo), y tras su cierre en 1868, se desplazó a la Universidad de Salamanca, donde en 1870 comenzó sus estudios, obteniendo en 1876 la licenciatura en Derecho Civil y Canónico.

Posteriormente, en el Seminario Conciliar de san Ildefonso (Toledo) obtuvo el doctorado en los Sagrados Cánones.

Esta doble faceta en su educación le hizo ser más respetable ante los diversos grupos intelectuales con los que hubo de tratar.

[4]​ En 1876, en Ciudad Real fue ordenado sacerdote por su tío paterno, Victoriano Guisasola y Rodríguez, obispo prior de las órdenes militares, a quien acompañó como canciller-secretario de Orihuela en 1882, y después, en Santiago de Compostela en 1886 al ser promovido a aquel Arzobispado.

Al fallecer su tío en 1888 fue nombrado vicario capitular.