El programa se caracterizó por la difusión de obras en géneros musicales hasta entonces desconocidos en el medio ecuatoriano como el madchester, shoegazing, trip hop y britpop, así como ediciones especiales anuales con motivo de Halloween, Navidad y covers.

Actualmente, El Vagón Alternativo se distribuye en formato podcast a través de Mixcloud.

El programa se concentró durante sus primeros años principalmente en artistas de Norteamérica, Europa y Asia.

Sin embargo, en 2009, el programa dio cabida inicialmente a artistas de habla hispana y meses después a producciones musicales independientes de Ecuador que aún no habían sido promocionadas en el dial, tales como Estéreo Humanzee, Motozen, Lagartija Electrónica, entre otras.

Se convirtió en la vitrina para artistas ecuatorianos independientes de géneros musicales alternativos, que se limitaban a una audiencia en internet y que tras su difusión en el programa alcanzaron mayor acogida en otras emisoras e inclusión en festivales nacionales.