[2]​ Gigantescas naves espaciales aparecen sobre las mayores ciudades del mundo, y Anna, la bella y carismática líder de los Visitantes extraterrestres, proclama que vienen en son de paz.

Erica se une al movimiento de resistencia, entre los que se encuentran Jack, un sacerdote con dudas sobre las intenciones de los Visitantes; y Ryan, un agente Visitante desertor quien, como otros como él ha podido liberarse del dominio casi hipnótico que Anna, líder de los visitantes, tiene sobre su gente.

Sin descuidar a los rebeldes, Anna envía una nave cargada con personas muertas previamente, y pensando que había Visitantes adentro, la Quinta Columna la destruye, sin darse cuenta de que las intenciones de Anna eran hacerlos quedar como terroristas, pero la Quinta Columna no se da por vencida, después de causar varios inconvenientes a los planes de los visitantes, terminan haciendo que Anna llegue hasta las últimas consecuencias, lastimando fuertemente a su propia hija, Erica intenta persuadir a Lisa para que confiese que Anna le hizo eso, sin poder lograrlo.

Poco después, Anna anuncia que debido a lo que le pasó a su hija, decidieron irse del planeta, causando una reacción masiva por parte de los humanos, Chad a través de un noticiero convence a los Visitantes de quedarse y estos aceptan, La Quinta Columna tiene un plan, para destruir un ejército de reptiles, que iban a salir de unos huevos que estaban en la nave madre, para lograrlo se contactan con Joshua, otro visitante que escapó del control mental de Anna (al igual que Ryan).

El periodista Chad Decker se da cuenta de la situación gracias a que Jhosua le advierte que los alienígenas torturan gente y quieren dominar el planeta.

La incorporación a la serie y su promoción creó muchas expectativas con esta segunda temporada, pero los índices de audiencia en Estados Unidos son flojos y no aseguran del todo una tercera temporada.

Lisa descubre la prisión de la Reina madre Diana y contacta asiduamente con ella.

En el episodio 10 se contempla la forma que tienen los visitantes al ver eclosionar el huevo de reina que Anna estaba haciendo crecer aceleradamente.

A lo largo de la segunda temporada son mencionadas las otras ciudades y se conoce de nuevas naves mediante mapas que se logran ver en la serie.

En agosto de 2009, el productor ejecutivo, Scott Peters, sugirió que estrellas de la serie original podrían participar como artistas invitados interpretando nuevos personajes.

Las impactantes imágenes muestran a las naves sobre las ciudades de Sídney, París, Londres, Buenos Aires, Madrid, Los Ángeles, Shanghái, Caracas, Río de Janeiro, México, Ankara, Roma, Johannesburgo y Moscú.

En Warner Channel Latinoamérica, una interrupción en las publicidades de Two and a Half Men, Friends y The Big Bang Theory fue una de las estrategias utilizadas para difundir la serie.

En ellas se veía el rostro de una bella mujer (Anna) diciendo: "Venimos en paz...