Fue fundado en 1998 y jugó en la Categoría Preferente de Las Palmas.
Fundado en 1998, como filial del Universidad de Las Palmas y formado por varios jugadores que fundaron cuatro años antes el primer equipo.
Al año siguiente se proclaman campeones de la Categoría Preferente de Las Palmas y ascienden nuevamente a tercera.
En la temporada 2009/10 realizan una mala segunda vuelta y terminan descendiendo.
El Universidad B juega sus partidos oficiales en el estadio Jorge Pulido desde el año 2008.