Su origen remonta a 1924, año en el que se fundó una escuela primaria femenina.El establecimiento ofrecía entonces un primer ciclo universitario cuyos graduados podían seguir estudiando en otras universidades del extranjero, y mantenía a la vez el instituto de secundaria.Para abarcar la gestión de un establecimiento de más tamaño, la dirección fue confiada a una junta directiva autónoma en 1973 pero hubo que esperar varios años para que las autoridades militares israelíes la autorizaran oficialmente.Ese mismo año, la universidad fue cerrada por primera vez dos semanas por una orden militar israelí, y en 1974, tras unas manifestaciones estudiantiles a favor de la OLP, Hanna Nasir fue deportado hacia Líbano y permaneció exiliado en Jordania hasta 1993.Los primeros graduados en humanidades y en ciencias se licenciaron en julio de 1976.Pero la presión internacional y las protestas locales obligaron a anular la orden al poco tiempo.Durante este tiempo, la Universidad siguió dando clases a sus estudiantes de forma semiclandestina, formando pequeños grupos de estudio en locales improvisados fuera del campus.Abarcan campos tan diversos como la salud pública, las relaciones internacionales, los medios de comunicación, el medio ambiente y la gestión del agua, las mujeres, los estudios jurídicos y laboratorios de pruebas científicas, entre otros.
