Se unió al Grupo de Batalla del portaaviones USS Midway.[1][2] Al finalizar la Guerra del Golfo, el Bunker Hill participó de la Operación Southern Watch.[1] El Bunker Hill efectuó una visita histórica a la ciudad de Vladivostok, Rusia.[1] En julio de 1998 el Bunker Hill cambió su base volviendo nuevamente a San Diego.UU. al Congreso sobre el plan anual a largo plazo para la construcción de buques navales indicó que estaba previsto colocar el barco fuera de servicio en reserva en 2023.