Formó parte del UCI WorldTour 2016, siendo el 2.º monumento de la temporada ciclística, correspondiente a la octava carrera del calendario de máxima categoría mundial.
En total la carrera contó con 18 muros y 7 tramos de pavé.
Esta edición contó con la vuelta de destacados ciclistas con aspiraciones a ganar la carrera, como Fabian Cancellara y Tom Boonen, que en la pasada edición no pudieron competir.
Todos los equipos estuvieron formados por 8 ciclistas, completando un pelotón de 200 corredores.
El Tour de Flandes otorgó puntos para el UCI WorldTour 2016, para corredores de equipos en las categorías UCI ProTeam, Profesional Continental y Equipos Continentales.