Impartió clases en la University College Dublin, la mayor universidad del país, y fue miembro de la Liga Gaélica, fundada en 1893, en la cual promovió la conservación de la lengua celta en la isla.

En cuanto a su trabajo literario, si bien no llegó a destacar a nivel nacional en el llamado Renacimiento céltico, movimiento liderado -entre otros- por W. B. Yeats, su obra refleja en gran medida el nacionalismo irlandés de la época y las tensiones sociales derivadas.

[1]​ Junto a su Historia de la literatura anglo-irlandesa (obra que dedicó a George Sigerson, probablemente su mayor influencia), escribió acerca de su crisis religiosa (tras la cual se decantó por el nacionalismo) en su poemario Through the Ivory Gate, y cultivó un realismo con grandes dosis críticas en dramas como When the Dawn is Come, Metempsycosis y Pagans.

Obras poéticas que merecen ser destacadas son Lyrical Poems, April and May, The Golden Joy y Songs of Myself.

Durante los meses posteriores a su muerte, se publicaron algunas antologías poéticas de MacDonagh, algunas junto a sus compañeros caídos, Pearse y Plunkett; destaca The Poetical Works of Thomas MacDonagh, publicada en septiembre de 1916 con prólogo de James Stephens, novelista que más tarde sería amigo de James Joyce.