En 1995 consiguió su doctorado cum laude con la disertación Sodoms zaad in Nederland.

Het ontstaan van homoseksualiteit in de vroegmoderne tijd.

[1]​ A 2007, van der Meer trabajaba como investigador en el Internationaal Instituut voor Sociale Geschiedenis (IISG; «Instituto Internacional de Historia Social»), donde trabaja en el proyecto «Homosexualidad en el siglo XX».

En 2007 publicó una completa biografía del primer activista gay de los Países Bajos, Jacob Anton Schorer, que también puede ser contemplada como una biografía de la homosexualidad misma.

A 2008 van der Meer estaba preparando una biografía de Piet Meertens.