The Best Of The Doors es un álbum recopilatorio del grupo norteamericano The Doors lanzado en 2000, y es diferente de los álbumes del mismo nombre lanzados en 1973 y 1985, respectivamente.
Los tres álbumes cuentan con una lista de canciones ligeramente diferente y una fotografía diferente del cantante Jim Morrison en la cubierta.
A diferencia de sus epónimos predecesores, el recopilatorio de 2000 incluye Break on Through (To the Other Side) y The End en su versión sin censura.
La canción "No Me Moleste Mosquito" apareció como El Mosquito en el álbum de 1972 Full Circle.
Este fue el segundo reconocimiento de la banda a su época post-Morrison desde la aparición de la canción Tightrope Ride tomada del álbum Other Voices de 1971 y compilada igualmente en su caja recopilatoria The Doors: Box Set de 1997.