El género se describiría más tarde en 2021 sobre la base del holotipo KKF 494, que representa solo una mandíbula parcial sin dentición.

[2]​ La especie tipo Thapunngaka shawi fue descrita por Timothy Richards, Paul Stumkat y Steven Salisbury del museo Kronosaurus Korner.

Sería entre 5.83 a 9.47 metros, basado en una extrapolación de Anhanguera piscator y Tropeognathus mesembrinus, respectivamente.

[1]​ El cladograma mostrado a continuación muestra la topología publicada por Richards y colaboradores en 2021, el cual a su vez se basa en el estudio de Borja Holgado y Rodrigo Pêgas de 2020:[1]​[4]​ Siroccopteryx Tropeognathus Mythunga Ferrodraco Thapunngaka Aerodraco Coloborhynchus Nicorhynchus Uktenadactylus Caulkicephalus Guidraco Ludodactylus Liaoningopterus Cearadactylus Maaradactylus Anhanguera En 2023, Richards et al.

publicaron una diagnosis revisada de Thapunngaka en la que además nombraron al clado Mythungini.