[2] En julio de 2015, el entrenador en jefe Paul Chryst le pidió a Watt que cambiara a una posición defensiva como estudiante de segundo año.
[3] Durante la temporada 2016, Watt registró 59 tacleadas, 11.5 capturas (sacks), una intercepción y un touchdown defensivo.
[8] Compitió con el veterano James Harrison y Bud Dupree por la posición de outside linebacker titular.
[11] En total inició o 16 de la temporada como titular y registró 68 tacleadas combinadas (50 en solitario), 13 capturas, seis balones sueltos forzados y tres desvíos de pase, por lo que fue invitado por primera vez al Pro Bowl en reemplazo del lesionado Jadeveon Clowney de los Houston Texans.
[15] También fue nominado para el premio al Jugador Defensivo del Año de la NFL, terminando tercero en la votación.
Quedó en segundo lugar en la votación al Jugador Defensivo del Año de la NFL, por detrás de Aaron Donald,[21] y fue nombrado por tercera vez al Pro Bowl y por segunda ocasión al primer equipo All-Pro.