Son organismos fotosintéticos y generalmente presentan dos cloroplastos, aunque algunas veces tienen solamente uno dividido en dos lóbulos.

Las células tienen dos flagelos heterocontos, insertados en paralelo y cuya ultraestructura es una característica que distingue al grupo.

Las escamas y espinas que cubren la célula se forman en la superficie de los cloroplastos.

Los pigmentos de los cloroplastos incluyen clorofilas a, c1, fucoxantina, violaxantina, antaxantina y neoxantina.

Synura vive en colonias esféricas, con las células orientadas de tal modo que los flagelos apunten hacia fuera.