La sustancia negra (Substantia nigra en Latín, también conocida como locus niger) es una porción heterogénea del mesencéfalo, y un elemento importante del sistema de ganglios basales (aunque no se la considere como un núcleo basal como tal).
Los axones dopaminérgicos inervan también otros elementos del sistema de ganglios basales incluyendo el pallidum medial la parte reticulada de la sustancia negra y el núcleo subtalámico.
En la parte reticulada y lateral la densidad de neuronas es mucho menor que en la compacta (también se conoce a estas regiones como parte difusa).
Sus dendritas así como el pálido están preferentemente perpendiculares a las aferencias estriadas.
Estas neuronas tienen una zona específica del núcleo ventral anterior desde donde se envía axones que llegan a la corteza oculomotora y frontal.