La primera opción para comandante supremo aliado en Europa fue el general del Ejército norteamericano Dwight D. Eisenhower, ya que había dirigido con éxito los desembarcos aliados en Normandía y la posterior marcha a Alemania durante la Segunda Guerra Mundial,[4]​ en medio de muchas controversias entre aliados sobre el correcto desarrollo de la campaña en el frente occidental.

[3]​ El general Eisenhower consideró la posibilidad de nombrar allí también a un comandante en jefe general, pero pronto se dio cuenta de que sería difícil encontrar un acuerdo que satisficiera a las tres grandes potencias con fuerzas en la Región Central —Estados Unidos, Reino Unido y Francia—, ya que tenían puntos de vista muy diferentes sobre la relación adecuada entre el poder aéreo y el terrestre.

Basándose en su experiencia en la Segunda Guerra Mundial, el general Eisenhower decidió mantener el control general por sí mismo y no nombró un comandante en jefe para la Región Central.

En su lugar, habría tres comandantes en jefe separados (aire, tierra y mar).

[7]​ Ese mismo día se activaron las sedes subordinadas del Mando Aliado de Operaciones en el norte y centro de Europa, y en la Región Sur en junio.

Blue Alliance fue un importante ejercicio de la fuerza aérea aliada para que las Fuerzas Aéreas Aliadas de Europa Central (AAFCE) lograran la supremacía aérea sobre el frente centroeuropeo y proporcionaran apoyo aéreo cercano a las fuerzas terrestres del NORTHAG bajo el mando global del teniente general Lauris Norstad, de la USAF.

Equinoccio fue un importante ejercicio aire-tierra en el que participaron unidades aéreas tácticas franco-americanas y una unidad de infantería aerotransportada francesa bajo el mando del general Alphonse Juin, del Ejército francés.

[17]​ Ese año, el Mando Aliado en Europa llevó a cabo la Operación Contragolpe, en la que participaron fuerzas de la AFCENT en el continente europeo, y otros dos grandes ejercicios militares en septiembre de 1957.

[20]​ Sin embargo, a partir de 1967, en el marco de la «respuesta flexible», el objetivo se convirtió en crear fuerzas convencionales para que, si fuera posible, no se necesitaran armas nucleares.

El entonces general Lyman Lemnitzer, SACEUR, esperaba que el SHAPE estuviera situado cerca del cuartel general de la OTAN, como había ocurrido en París, pero las autoridades belgas decidieron que el SHAPE debía estar situado al menos a cincuenta kilómetros de Bruselas, la nueva ubicación de la OTAN, ya que el SHAPE era un importante objetivo militar en tiempos de guerra.

En septiembre de 1966, la OTAN acordó que Bélgica acogería el SHAPE en Casteau.

Haig, que se había retirado del servicio militar para servir como jefe de Gabinete de la Casa Blanca para el presidente Richard Nixon durante las profundidades de la escándalo Watergate, fue instalado abruptamente como SACEUR después del desenlace del Watergate.

[27]​ Persona de costumbres, Haig tomó el mismo camino hacia SHAPE todos los días, un patrón de comportamiento que no pasó desapercibido para los grupos terroristas.

A partir de 1993, la plantilla del Mando Aliado en Europa se redujo en consonancia con las reducciones de personal ya en curso desde 1990 y con el Plan Schaefer, elaborado por el general alemán retirado Shaefer.

Estados Unidos deseaba mantener tres mandos, argumentando que «el alcance del control podría ser excesivo».

[31]​ Los funcionarios del Pentágono temían en ese momento que si se hubiera adoptado la estructura de dos mandos, algunas funciones a nivel del MSC habrían tenido que ser trasladadas «hacia abajo» en la nueva estructura.

[33]​ Además de los dos mandos continentales AFNORTHWEST cubrió el Reino Unido y Escandinavia.

Las preocupaciones de los tres países bálticos se centraban específicamente en una posible amenaza rusa.

En 2003, se creó una bandera francesa en el cuartel general del SHAPE en Mons tras el regreso, después de casi cuarenta años, de oficiales franceses al cuartel general.

[35]​ Se desarrolló una nueva estructura con tres cuarteles generales principales bajo el Mando Aliado de Operaciones:[36]​

El Cuartel General del Eurocuerpo, en Estrasburgo, Francia, es una fuerza de la Unión Europea con un acuerdo técnico que la vincula a la OTAN.