Murió en combate en la guerra ruso-japonesa al ser alcanzado el acorazado que mandaba por una mina japonesa.

Stepán Makárov nació en Nikoláiev (ahora Mykoláiv, Ucrania) en la familia de un práporshchik del Almirantazgo (прапорщик по Адмиралтейству, un oficial auxiliar).

Makárov participó[1]​ en la guerra ruso-turca (1877-1878) y fue condecorado por su servicio como capitán de la lancha torpedera rusa Veliki Knyaz Konstantín.

[1]​ Más adelante dirigió dos expediciones oceanográficas alrededor del mundo en la corbeta Vítiaz (1886-89 y 1894-96).

Makárov también propuso la idea de construir un barco que pudiera navegar en la banquisa y supervisó su construcción.

[10]​ Cuando en marzo cruceros japoneses bombardearon Port Arthur desde el mar Amarillo, sus cruceros devolvieron el fuego con tal intensidad que los barcos japoneses se vieron obligados a retirarse.

[9]​ Los buques de guerra japoneses se retiraron casi 15 millas mar adentro, con Makárov en su persecución.

Tras su muerte, un gran número de embarcaciones rusas fueron bautizadas como Almirante Makárov.

Una isla en el grupo Tsivolk del archipiélago de Nordenskiöld fue nombrada en su memoria.