Cada selección obtuvo un puntaje calculado según la instancia a la que haya llegado en los torneos antes mencionados, las selecciones fueron ordenadas en los bombos de acuerdo a este puntaje con excepción de Guinea Ecuatorial que fue asignada directamente al bombo 1.
Entre paréntesis se indica el puntaje obtenido por cada selección según el sistema de clasificación publicado por la CAF.
[1] EQG Guinea Ecuatorial (Anfitrión) GHA Ghana (48) CIV Costa de Marfil (44) ZAM Zambia (41) BFA Burkina Faso (40) MLI Malí (38) TUN Túnez (32.5) ALG Argelia (28) CPV Cabo Verde (26.5) RSA Sudáfrica (23.5) CMR Camerún (23.5) GAB Gabón (22) GUI Guinea (19) SEN Senegal (19) COD RD Congo (18) CGO Congo (13) Para calcular los puntos de las selecciones por su participación en las últimas tres ediciones de las copas africanas se adoptó el siguiente sistema de puntuación: El comité organizador dio mayor importancia a las ediciones más recientes por lo que los puntos obtenidos en el torneo del año 2013 fueron multiplicados por 3, los puntos del torneo del año 2012 multiplicados por 2 y los del torneo del año 2010 por 1.
La primera bolilla del bombo 2, que iría al grupo A, fue elegida por Teodoro Obiang Nguema, presidente de Guinea Ecuatorial.
[2][3] El procedimiento del sorteo fue como sigue:[4] Luego del sorteo los grupos quedaron conformados de la siguiente manera:[5][6] EQG Guinea Ecuatorial BFA Burkina Faso GAB Gabón CGO Congo ZAM Zambia TUN Túnez CPV Cabo Verde COD RD Congo GHA Ghana ALG Argelia RSA Sudáfrica SEN Senegal CIV Costa de Marfil MLI Malí CMR Camerún GUI Guinea