Tras la temporada de baños de 1877 se reanudaron las reuniones en las que se constituyó la primera Junta Directiva, de la que fue secretario general Benigno Villafranca y presidente José Salgado.
[4] No obstante la sociedad continuó su labor y los Anales volvieron a publicarse hasta 1936, momento en que la actividad de la sociedad se paralizó por la guerra civil española (1936 - 1939).
La sociedad está regida por una Junta Directiva que está formada por una presidencia, una vicepresidencia, una secretaría general y una tesorería además de ocho vocalías.
Los cargos principales en 2010 los ocupan los doctores Juan Carlos San José Rodríguez (presidente), Juan Andrés Barroso Fernández (vicepresidente), María Ángeles Ceballos Hernansanz (secretaria general) y Miguel Ángel Colomer Rodríguez (tesorero).
Pertenece como miembro a la International Society of Medical Hydrology and Climatology y a la Federación de Asociaciones Científico Médicas Españolas.