Fue fundado el 29 de diciembre de 1923, siendo el único equipo de fútbol profesional más antiguo en existencia en Cotopaxi (y sexto en el país).
Actualmente juega en la Segunda Categoría de Ecuador, aunque en la actualidad debido a problemas institucionales no ha participado desde el año 2023 en este campeonato.
Está afiliado a la Asociación de Fútbol No Amateur de Cotopaxi.
Pasarían prácticamente casi 10 años con 6 meses para que nuevamente volviera a surgir tras la entrega de los derechos deportivos por parte del expresidente de la institución ?
y con la cooperación de las escuelas de fútbol de la Alcaldía de Latacunga como su cantera el Flamengo volviera a jugar nuevamente desde el torneo provincial del Cotopaxi para el 2016.