El punto más elevado de la sierra es el Pelado de Aguas Claras, el cual alcanza 3321 m s. n. m. y es a su vez el punto más elevado del suroeste de Nuevo México.
Las aguas termales que existen en el área son evidencia de dicha actividad volcánica.
La sierra de Mogollón debe su nombre a Juan Ignacio Flores Mogollón, gobernador de Nuevo León entre 1712 a 1715.
Pueblos posteriores que habitaron la región fueron las bandas chiricahua y mimbres de los apache.
Se ha sostenido que Gerónimo nació en esta zona hacia 1829.