Secuencia de reconocimiento
La secuencia de reconocimiento, a veces conocida como sitio de reconocimiento, es cualquier motivo de proteína de unión al ADN que muestra especificidad en su unión, se refiere a la secuencia de ADN (o subconjunto del mismo), que es específico del dominio.Las secuencias de reconocimiento son palíndromos.El factor de transcripción Sp1, por ejemplo, se une a las secuencias 5'-(G/T)GGGCGG(G/A)(G/A)(C/T)-3', donde (G/T) indica que el dominio se unirá una guanina o timina en esta posición.La endonucleasa de restricción PstI reconoce, se une y separa de secuencia 5'-CTGCAG-3'.Siempre es el mismo si en el primer sitio de reconocimiento o el segundo en la siguiente secuencia del ejemplo.