La Secretaría de Estado de Agricultura y Alimentación es el órgano superior del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación que, bajo la dependencia directa del ministro, propone y coordina las políticas del Departamento referentes a las actuaciones, objetivos y programas encaminados al desarrollo del medio rural.

[1]​ Posteriormente, dos décadas después, en 2008, encontramos otro antecedente indirecto al crearse una Secretaría de Estado de Medio Rural y Agua que, si bien tenía muchas más competencias, sí que concentraba en ella competencias sobre agricultura y alimentación.

[2]​ Este órgano existió hasta finales de 2011.

Sin embargo, el antecedente directo de este órgano es la Secretaría General de Agricultura y Alimentación, un órgano directivo con rango de Subsecretaría que, con algunas interrupciones, ha asumido las competencias sobre agricultura, alimentación, industria alimentaria y desarrollo rural del Departamento desde 1996.

Este hecho fue celebrado por la prensa especializada,[4]​[5]​ así como por el propio ministro de Agricultura, Luis Planas, que calificó el hecho ante el Pleno del Senado, en su comparecencia del 21 de noviembre, como el primer paso para desarrollar una Estrategia Nacional de Alimentación.