Empezó su carrera futbolística en inferiores en el Club Atlético Banfield, donde estuvo por seis años pasando por distintas categorías inferiores, llegando a entrenar con primera división y jugar para reserva con 18 años de edad.
En el año y medio que duró su estadía en Atlanta pudo ser parte de los 18 citados en 8 encuentros.
En ese club estuvo por dos temporadas consecutivas consiguiendo, en la segunda temporada, el ascenso a la Primera B Metropolitana después de salir Campeón con una de las vallas menos vencida del torneo.
En CADU fue donde Sebastian tuvo grandes actuaciones, tanto en el campeonato local y, sobre todo, en la Copa Argentina.
En este club, jugó 44 partidos donde pudo mantener 18 veces su valla invicta, de las cuales 8 fueron consecutivas; y recibió solo 37 goles.