Santa Rosa de Aguán es un municipio del departamento de Colón en la República de Honduras.

[2]​ Su nombre es en honor a Rosa de Lima, santa de la iglesia católica y Aguán proviene de náhuatl que significa: Lugar de Muchas Aguas, haciendo referencia al Rio Aguán que fluyan en este municipio.

En 1887, formaba parte del municipio de Trujillo.

En 1998, la zona fue asolada por inundaciones debido al paso del Huracán Mitch, que dejó un saldo trágico de 42 fallecidos y la infraestructura local destruida.

Las fiestas patronales son celebradas en el mes de agosto en honor a Santa Rosa de Lima.