San Lázaro fue fundada el 15 de agosto de 1924 por el Capitán Lázaro Aranda, en el mismo lugar donde se unen los ríos Apa y Paraguay, que vino en una lancha junto a sus familiares.
San Lázaro fue fundada en época de creciente y, cuando lo fue, ya estaba habitada por pocas personas.
La temperatura máxima alcanza los 40 °C, en verano, mientras que la mínima en invierno es de hasta menos -2 °C.
Los vientos son del norte, este y sureste.
La localidad principal de este distrito es el puerto de Valle-mí conocida como la capital del cemento Actual Capital del Distrito, ubicada a 14 km más al sur, donde se encuentra la cantera de la mayor empresa de cemento del Paraguay, la Industria Nacional del Cemento (I.N.C.).