San Juan de Manapiare es un pueblo ubicado en el estado venezolano de Estado Amazonas (Venezuela) y capital del municipio Manapiare.
Tiene una población de 8771 habitantes (según el censo 2011).
La aldea se halla en una zona selvática a orillas del río Manapiare, al sur de la Serranía Guanay y al este del Cerro Morrocoy.
San Juan de Manapiare fue fundada en 1940 por el explorador Don Melicio Pérez.
Aun así, es posible llegar al pueblo a través de una carretera que viene del Orinoco hacia el Sur y pasa por la Serranía Guana.