San Francisco en honor al santo católico.

Atotonilco del náhuatl: Atotonilli, Agua Caliente, Co, Lugar.

[8]​ La localidad se encuentra localizada en las coordenadas geográficas 20°11′41.966″N 98°9′5.912″O / 20.19499056, -98.15164222, con una altitud de 1781 m s. n. m.[9]​ Se encuentra a una distancia aproximada de 10.75 kilómetros al noreste de la cabecera municipal, Acaxochitlán.

[11]​[12]​[13]​ En lo que respecta a la hidrología se encuentra posicionado en la región Tuxpan-Nautla, dentro de la cuenca del río Cazones, en la subcuenca del río San Marcos.

[11]​[12]​[14]​ Cuenta con un clima templado húmedo con lluvias todo el año.