Su Cabecera municipal se encuentra dividida en los siguientes barrios: 20 de abril, 21 de enero, Arabia, Centro, Chico, Chipana, Chiriaimo, Don Camilo, El Carmen, Galán I y II, Guayabal, La Victoria, Las Delicias, Las Flores, Los Laureles, Múnich, Niño Jesús, Nuevo Amanecer, Pablo VI, Paraíso, Pedro Agustín, Villa Libia, Urbanización COOVISAN.

San Diego tiene bajo su jurisdicción los centros poblados: NORTE: Partiendo de la intercepción del río Chiriaimo con la proyección del emisario norte, siguiendo por este aguas arriba hasta el límite con el Municipio de La Paz.

SUR: Partiendo de la intercepción del Arroyo Pereguetano con la vía que desde el predio Chaparral conduce al predio el Manantial, siguiendo por este arroyo aguas abajo hasta su intercepción con la acequia la Paulina.

OCCIDENTE: Partiendo de la intercepción del río Chiriaimo con la proyección del Emisario Norte, bajando por esta proyección en el sentido norte-sur hasta encontrar la acequia la Paulina, siguiendo por estas aguas abajo hasta su desembocadura en el Arroyo Pereguetano.

En la actualidad estas actividades se han visto afectadas por los conflictos socios políticos que ocurren en la región, lo cual ha generado una gran depresión económica en el municipio.

En este sentido las aguas subterráneas constituyen una opción, que por sus características de menor exposición son menos vulnerables, pero que requieren de un manejo apropiado para garantizar su óptima calidad.

Además de su uso para consumo humano, las aguas subterráneas de menor calidad pueden ser utilizadas para la industria y la agricultura, representando una alternativa importante para aquellas zonas en las que el déficit del recurso hídrico superficial limita el desarrollo normal de estas actividades.

La extracción de agua subterránea está cerca y por encima de los valores calculados para la respectiva recarga en períodos anuales, lo cual reclama estudios hidrogeológicos específicos para definir dicho balance y para controlarlo y darle a partir de ello un manejo sostenible al recurso.

Esto para los primeros meses del año, para el resto del año la dirección es variable y su velocidad es un poco más fuerte, sobre todo en el mes de octubre.

En época de invierno se presentan vendavales producidos por los vientos que vienen del hemisferio norte.

Su suelo está constituido por capas predominantemente calcáreas, relativamente rico, aunque pobre en drenaje debido a las características impermeables de esta capa y están representados por las siguientes tipologías: Unidad sedimentaría La Quinta (JQS) construida por sección monótona de limolita rojas silicias ocasionalmente arenosa masivas con fractura concoidea estratificación plan paralela generalmente en laminasa delgadas hasta capas muy gruesas.

Además presenta vastas zonas compuestas por Terrazas de abanicos Aluviales (Qt), Ingnibritas (Jvl) y Aluviones Recientes (Qlla) que representan más del 80% del territorio municipal.

Lo anterior contrasta en la disminución en el área sembrada que ha venido presentando este cultivo, ya que en 1996 se establecieron 40.874 Ha, pasando en 1997 a 26.722 ha Con respecto al rendimiento por hectárea los departamentos con mayor porcentaje son: Córdoba, Huila, Meta, Risaralda, Valle, el departamento con mayor producción es Córdoba y la participación del Cesar frente a la producción nacional en 1997 fue de 6.6%; el total de producción nacional es de 309.347 toneladas.

San Diego no se encuentra dentro de las principales comunidades pesqueras del departamento, porque la actual infraestructura para el desarrollo de este sector es insuficiente y poco técnica.

Existe una infraestructura piscícola, compuesta por espejos de agua que van entre 6.000 y 8.000.

El desarrollo relativamente reciente del sector minero, ha generado cambios en la estructura económica actual y seguirá abriendo nuevas perspectivas sobre las actividades de intercambio y producción de la región.

Próximamente se planea explotar el llamado Bloque II CESARITO, el cual se extiende desde la población de San Juan del Cesar al norte de la Guajira, hasta las poblaciones de Agustín Codazzi y San Diego, al sur.

El actual Alcalde municipal es Unaldo Rocha Calderón (2024-2027), elegido por voto popular.