Este eran republicanos más extremistas, que lo llevaron a ingresar en la francmasonería en 1862, distinguiéndose después por la actuación constante en las logias barcelonesas.

Una vez se produjo la restauración borbónica (1874) colaboró en La Gaceta de Buenos Aires y fue afecto a Emilio Castelar hasta que éste fundó el Partido Republicano posibilista.

Obtuvo varias pensiones para hacer investigaciones históricas en archivos del extranjero entre 1872 y 1873.

Su libro más trascendental es Los cuatrocentistas Catalanes (Barcelona, 1912 ); historia crítico-descriptiva de la escuela pictórica de Cataluña del siglo XV, la existencia y valor positivo demuestra gráfica y documentalmente, aunque la crítica posterior (mosén Josep Gudiol y Cunill , Josep Maria Folch i Torres , Vicente Lampérez , Bonaventura Bassegoda i Amigó) señalará algunas inexactitudes, deficiencias y omisiones en la obra de Sanpere.

Inclinado en un principio al krausismo, más tarde adoptó las doctrinas positivistas.