El topónimo y la localidad de Rates (del término Ratis) parecen ser anterior a la romanización.
Rates se desarrolló gracias al monasterio fundado por el Conde D. Henrique en 1100.
A comienzos del siglo XVI, el monasterio se desorganizó, lo que llevó a que en 1517 se hubiese extinguido y transformado en Encomienda de la Orden de Cristo.
Estaba constituido solo por la freguesia de la sede y tenía, en 1801, 709 habitantes.
Toda la villa se ha desarrollado alrededor del monasterio de Rates.