São João do Itaperiú es un municipio brasileño del estado de Santa Catarina.
Itaperiú es una palabra de origen tupí guaraní y era utilizada por los indígenas para referirse al río que atraviesa el lugar.
Según el diccionario tupí, Itaperiú significa "cabeza de piedra".
A principios del Siglo XX se instalaron los primeros inmigrantes italianos, provenientes de Luiz Alves.
En 1916 se instaló la primera capilla, con una imagen del Juan el Bautista patrono de la ciudad.