Tras los malos resultados del primer equipo, el 21 de octubre de 2015 se decidió destituir al entrenador del primer equipo, Gaizka Garitano, en su lugar llegó Miguel Ángel Portugal y Rubén Albés pasó a ser el segundo entrenador dejando el filial.
El 6 de junio se confirmó que volvería a tomar las riendas del Real Valladolid "B" para la temporada 2016-17.
En 2017, se marchó para ser entrenador del Celta "B", con el que jugaría la primera temporada los play-offs de ascenso a Segunda División, siendo eliminado en semifinales por el F. C. Cartagena.
En la siguiente temporada, la 2018-19, lograría la permanencia a última hora en el play out frente al C. D. Alcoyano.
Al término de la temporada no continuaría en el banquillo del conjunto gallego.