Realizó postgrados en Dirección General de Empresas (ISEDE) y en Competitividad (UCUDAL).
Entre 1992 y 2000 se dedicó al ejercicio liberal de la abogacía.
En el periodo 2000-2003 se desempeñó como director del Instituto Nacional de Abastecimiento.
En 2006 fue fundador del movimiento Idea Nacional y en 2008 de la agrupación Lista 40.
En 1998, Goñi se casó con la médica psiquiatra Gabriela Dartayete, con quien tiene tres hijas: Magdalena, Elisa y Rosario.