Durante el período colonial español, Argentina fue parte del Virreinato del Río de la Plata y se administró desde Buenos Aires mientras que las Filipinas fue gobernado desde el Virreinato de Nueva España en la Ciudad de México.

En abril de 1949, las Filipinas abrió una legación diplomática en Buenos Aires.

En octubre de 1995, el Presidente argentino, Carlos Menem, también realizó una visita a las Filipinas.

[4]​ En febrero de 2014, ambas naciones celebraron la segunda reunión de consulta bilateral en Manila, donde acordaron mejorar aún más las relaciones comerciales bilaterales.

[5]​ En 2018, ambas naciones celebraron 70 años de relaciones diplomáticas.