Tras esta edición desapareció la competición como producto de la profunda remodelación de las competiciones europeas que tuvo lugar entonces.

Participaron 49 clubes pertenecientes a 48 federaciones nacionales diferentes.

La final, disputada a partido único, enfrentó al Mallorca con la Lazio en el estadio Villa Park, en Birmingham, donde venció el equipo italiano por 2-1.

El triunfo de la Lazio le permitió quedarse con el trofeo en propiedad.

CD Campeón Defensor Procházka Nečas Skuhravý Barteska Jirousek Špoljarić Papavasiliou Kavazis Germanos Los máximos goleadores de la Recopa de Europa 1998–99 fueron: