Su exitosa carrera en el cine Bollywood le ha permitido ganar siete veces el premio Filmfare.
Su primera película en hindi y verdadero debut, con solo 18 años, fue Raja Ki Aayegi Baraat (1997).
Fue precisamente en Kuch Kuch Hota Hai la multipremiada película dirigida por Karan Johar donde ganó su primer Premio Filmfare como Mejor Actriz de Reparto interpretando a la bella y sexy Tina Malhotra, junto a las estrellas Shah Rukh Khan, Salman Khan y Kajol.
Así llegamos al 2006: un gran éxito, Kabhi Alvida Naa Kehna, y una película que tuvo un comportamiento pobre en taquilla, Baabul.
Varios grupos la acusaron entonces de no haber detenido la paliza, y Mukerji se disculpó.