En Los Ángeles, Phoenix y sus hermanos actuaban en la calle delante de otros niños.
Otros papeles pequeños le siguieron, incluyendo Amazing Stores en 1986 (acreditada como Rainbow Phoenix) y Family Ties en 1987.
También en 1987, Phoenix participó en la película Maid to Order, junto a Ally Sheedy.
En esta época, la carrera de River había despegado y la banda tenía que hacer parones para ajustarse a su agenda.
En 1988, Aleka's Attic firmaron con la discográfica Island Records y en 1989 lanzaron su sencillo "Across the Way" en un álbum benéfico a favor de PETA.
En este momento, Phoenix se unió a su hermano River en el set de su décima película, My Own Private Idaho.
Conoció al director Gus Van Sant, al que River le sugirió que sería perfecta para un papel en Even Cowgirls Get the Blues, basada en la novela homónima de Tom Robbins.
Tuvo el papel de Bonanza Jellybean, compartiendo pantalla junto a Uma Thurman.
Su álbum "Let's Make Babies in The Woods" fue lanzado a principios se 2011.