Su recorrido comienza en el extremo sur del lago Miccosukee, al noroeste del condado de Jefferson, como río subterráneo para aflorar y fluir durante 56 km.Tiene una cuenca hidrográfica de 861,0 km²; y un afluente principal, el río Wakulla.Marks pasa bajo un puente natural y desaparece para convertirse en un río subterráneo durante casi 2,5 km.Marks se encuentra en la intersección de los ríos Wakulla y St.Mark y Newport hay una pequeña zona industrial a la que dan servicio gabarras.
El río St. Marks River visto desde la autopista 98 de EE. UU., en
Newport, Florida
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