El río forma una parte importante de la frontera entre Afganistán y Tayikistán.
Luego se une al río Vajsh para formar el Amu Daria.
El Panj recibe numerosos y abundantes afluentes, tanto por la orilla derecha como por la izquierda.
Los principales están, no obstante, en la margen derecha y son todos de Tayikistán.
En la ribera izquierda (afgana), el afluente más importante del río Panj es el Kokcha, que tiene una longitud de unos trescientos veinte kilómetros.