El río nace en la parte meridional de los montes Yáblonoi, que se encuentran en la orilla oriental del lago Baikal.

Discurre gobalmente en dirección sudoeste, siguiendo el eje de estos montes.

El caudal del Itantsa ha sido observado durante 38 años (1960-1997) en Turutayevo, localidad situada a 22 km por encima de su confluencia con el Selengá.

En el mes de junio el caudal disminuye y se estabiliza rápidamente.

Caudal medio mensual del Itantsa (en m³/s) medido en la estación hidrométrica de TuruntayevoDatos calculados en 38 años