[1]​: 475 El río Collileufú posee una estación fluviométrica en su cauce inferior ubicada muy cerca de su junta con el río Calle Calle, en su paso por la ciudad de Los Lagos, a 25 m s. n. m.[2]​: 48 La subcuenca del río Calle-Calle que incluye las subcuencas de sus principales afluentes, los ríos San Pedro y Collileufú tiene un claro régimen pluvial, con la única excepción del río Liquiñe, afluente del lago Neltume, el que presenta un régimen pluvio–nival.

En años lluviosos las crecidas ocurren entre junio y agosto, resultado de importantes aportes pluviales.

En años secos o normales se mantiene la importancia de los aportes pluviales, con los mayores escurrimientos entre junio y agosto.

El período de menores caudales se presenta en el trimestre entre enero y marzo.

[2]​: 51 El caudal del río (en un lugar fijo) varía en el tiempo, por lo que existen varias formas de representarlo.